Term
Hvorfor klynger(cluster) fedtsyremolekylerne sig sammen i miceller? |
|
Definition
For at opnå det mindste mulige hydrofobe overfladeareal til vandet. Dette gør at der kræves færre vandmolekyler i skallen med ordnet vand. |
|
|
Term
Opskriv fase ligevægtsmodellen? |
|
Definition
|
|
Term
Hvad er vigtig ved "self aggregation"? |
|
Definition
|
|
Term
Formel for kritisk pakningsparameter? |
|
Definition
|
|
Term
Hvordan kan man for et lipidmolekyle få en anden aggregats struktur? |
|
Definition
Ved lokalt at ændre geometrien |
|
|
Term
Hvad kan gøre at man får ændringer i lipidstruktur, som kan udøve stærke ændringer i membranernes fysiske egenskaber? |
|
Definition
Eksterne faktorer, så som temperatur, hydrering eller virkning af lipolytiske enzymer |
|
|
Term
Nævn de parametre, der påvirker overgangstemperaturen i hovedfasen ved lipid-dobbeltlag |
|
Definition
1) Længden af den hydrofobe lipidhale
2) Graden af umættelse af lipidhalen
3) Arten af den polære hovedgruppe
Meget orden i membranlaget = bliver fast.
Meget uorden i membranlaget = bliver for flydende.
Mættede fedtsyrer -> nemmere at pakke -> mere fast.
Længere fedtsyrekæder -> sværere at pakke -> mere flydende.
En membran skal helst gerne være hverken fast eller for flydende. |
|
|
Term
Beskriv kolesterol effekten? |
|
Definition
Sørger for at membranen hverken bliver flydende eller fast. Påvirker fluiditeten. Sørger for at membranen stadig er flydende ved lave temperaturer og stadig er fast nok ved højere temperaturer.
Bonus: Cellen kan aktivt regulere mængden af kolesterol til de forskellige membraner. |
|
|
Term
|
Definition
1. interaktion med en amfipatisk helix
2. interaktion med en hydrofob sløjfe
3. interaktion med et kovalent bundet membranlipid (lipidering) 4. elektrostatisk interaktion |
|
|
Term
Hvad skal proteiner indeholde før de kan bøje membraner? |
|
Definition
Proteiner med iboende krumning kan hjælpe med at bøje membraner til endo- og eksocytose. |
|
|
Term
Nævn nogle af transmembrane proteiners funktioner? |
|
Definition
Signalering, enzym, transport |
|
|
Term
I hvor mange grupper inddeles transmembranproteiner og hvordan? |
|
Definition
Seks grupper og efter hvor mange helices de har og hvordan N- og C-terminus vendes i forhold til det intracellulære miljø. |
|
|
Term
Hvad gør Tyr- og Trp-rester af membranproteiner? |
|
Definition
Klynger sig sammen med vand-lipidgrænsefladen |
|
|
Term
Hvordan oprenses membranproteiner? |
|
Definition
Med ultracentrifugering og detergensbehandling. |
|
|
Term
Hvordan dannes membran porer og hvad er det særligt de gør? |
|
Definition
Når protein spænder over membranen flere gange, dannes der normalt porer, der tillader molekyler at bevæge sig frem og tilbage gennem membranen |
|
|
Term
Hvordan dannes beta tønder (beta barrel)? |
|
Definition
betatønder er lavet af betaplader, der er buede til en cylinder.
Bonus: Større pore end alfa helix-pore |
|
|
Term
Hvad bruges "Detergents" til? |
|
Definition
Bruges til at fjerne proteinerne fra membranen
Bonus: Har en enkelt carbonhydridhale og danner små klynger i vandige opløsninger kaldet miceller
|
|
|
Term
Hvordan oprenser man proteiner? |
|
Definition
Man tager en celle og slår den i stykker og laver man en centrifugen
Herefter tilføjer man en detergent.
Når proteinet kommer ud af membranen, vil den ændre form til de nye omgivelser - ved tilføjelse af detergent, vil man opnå den samme form igen. Alt efter hvad man vil tjekke tilføjer man meget eller lidt detergent. |
|
|
Term
Hvad er det særlige ved perifere membranproteiner? |
|
Definition
|
|
Term
Nævn forskellige måder som stoffer kan tranportes over membranen? |
|
Definition
1. Passiv og dermed uden forbrug af energi 2. Nogle stoffer binder til en receptor inden og bliver skilt efter de kommer ind 3. Primær aktiv transport (imod elektrokemisk gradient) 4. Sekundær aktiv transport (imod elektrokemisk gradient) 5. ion kanal 6. simple diffusion |
|
|
Term
Hvordan kan man transportere aminosyrer ind i cellen? |
|
Definition
Der ophobes en koncentration af Na+ udenfor cellen, hvilket kan blive transporteret ind i cellen igen sammen med en aminosyre. |
|
|
Term
Hvad er forskellen på ATP-powered pumps og ion kanaler? |
|
Definition
ATP-powered pumps er langsommere end ionkanaler
Bonus: ATP-powered pumps har fri energi
|
|
|
Term
Hvad er det vigtigste ved osmotisk tryk? |
|
Definition
Samme mængde frie vandmolekyler på begge sider. Derfor kommer der et stigende tryk, da vandmolekylerne bevæger sig frem og tilbage over membranen for at udligne trykket (det osmotiske tryk).
Bonus: Mængden af frie vandmolekyler bliver reduceret.
Forklaring:Hvis der fx på den ene side af membranen er et protein, som vand interagerer med, da vil mængden af frie vandmolekyler på den side være mindre og vand vil da "hives/skubbes" fra den modsatte side og over på protein-siden.
|
|
|
Term
Hvad er aquaporiners funktion? |
|
Definition
Danner hydrofile transmembrane kanaler til passage af vand
Bonus; Kun et vandmolekyle ad gangen.
|
|
|
Term
Hvordan kan man udligne koncentrationsgradient? |
|
Definition
Hvis begge ioner kan permeerer frit over membraner, så vil de udligne deres koncentrationsgradient og dermed udligne koncentrationerne på hver side af membranen |
|
|
Term
Hvilke to gradienter følger faciliteret diffusion af ladede partikler? |
|
Definition
a) koncentrationsgradient;
b) ladningsgradient (spænding) |
|
|
Term
Hvad kan man bruges ”Patch-clamping” til? |
|
Definition
Ion-kanal funktion måles. Man kan herved finde mekanismen for forskellige transport proteiner.
Bonus;K passer bedre i poren end natrium - derfor er der stor sandsynlighed for at natrium diffunderer væk igen.
|
|
|
Term
Beskriv neuronal Na+ kanalen? |
|
Definition
Er en spænding-lukket ionkanal(Kan mærke spændingen og derefter aktiveres/inaktiveres.)
En kanal, der er afhængig af et specifikt potentiale.
Kun natrium kan komme igennem
Fire domæner er indpakket omkring en central transmembrane kanal |
|
|
Term
Beskriv acetylcholinreceptoren? |
|
Definition
Er en Ligand-portet ionkanal. Binder her en neurotransmitter - ved binding => depolarisering af membranen => aktionspotentiale => kan sendes videre til den næste neuron. Binding af acetylcholin => åbning af pore og ioner kan komme igennem og potentiale opnås. Lukkes hurtigt igen, så aktionspotentiale kan genopbygges
|
|
|
Term
Nævn en ionkanal som kan reguleres af membranmekanik? |
|
Definition
vaskulær mekanosensormodel.
Bonus: Mekanosensering er vigtig
- I bakterier for at undgå osmotisk brud - i det menneskelige øre osv. ... |
|
|
Term
Beskriv glukosetransportøren af Erythrocytes(røde blod celler) mediator
Bonus: Det er en Carrier |
|
Definition
- Carrier er ikke det samme som en kanal - der sker konformationsændring.
- Ved carrier skal substratet binde sig til proteinet og ændringen sker. - Der opnås på et tidspunkt et mætningspunkt - hvis alle transportere allerede har et glukose molekyle bundet, så transporterer de ikke hurtigere ved at have mere glukose.
Bonus; En carrier kan sammenlignes med et enzym - ses på kinetikken, som er den samme som Michealis-Menten indenfor enzym-kinetik. |
|
|
Term
Beskriv Sekundær aktiv transport |
|
Definition
Sekundær transport: her ses en X gradient - denne gradient kan benyttes til at transportere S ind i cellen. Benytter sig af en bestemt gradient for at transportere et bestemt molekyle over en membran.[image] |
|
|
Term
Hvilke fire ATP-powered pumps findes der? |
|
Definition
P-type: plasmamembran i planter, gær, svampe.
V-type: V for vacuole.
F-type: ligner V-type meget. Danner ATP. ABC: transport og fjernelse af lægemidler. |
|
|
Term
Nævn de slags p-class pumper og beskriv dem kort. |
|
Definition
Na/K pumpe - 3 Na+ ud af cellen sammen med 2 K+ ind i cellen. Afgørende for membranpotentiale - ofte negativ indeni cellen. Bindingsligevægt, så de kan komme væk
Calcium pumpe - fjerner calcium fra cytosol og ophober den i det endoplasmatiske retikulum. Opretholder en lav koncentration af calcium i Cytosol.
|
|
|
Term
Nævn en V-class pump og beskriv den kort |
|
Definition
Protonpumpen - kobler ATP-hydrolysen til dannelse af en protongradient over membranen. Mekanismen indebær rotation i proteinet.
Bonus: Det bliver sværere og sværere at transportere positive ladninger - derfor har de en Cl- kanal. Det gøres nemmere ved at udligne ladningen inden i cellen |
|
|
Term
Hvorfor lav pH i lysosomer? |
|
Definition
Enzymerne opnår nemmere binding til ligander.
Affiniteten mellem enzym og ligand falder ved højere pH. Hvis der derimod er højere pH kan endosomer transportere receptorer videre til andre dele ved endocytose. |
|
|
Term
Hvorfor er der surt miljø i lysosomer? |
|
Definition
bruges for nedbrydning af næringsstoffer. |
|
|
Term
I biologiske membraner er der to ting som påvirker membrantransport og interaktion med proteiner, hvilke?
|
|
Definition
et overfladenpotentiale (surface potential) og et dipolpotentiale.
Bonus: Dipolpotentiale = fordi der er ingen ladning indeni membranen og måske en ladning udenpå membranen. |
|
|
Term
Hvad er det vigtigste ved flux? |
|
Definition
Flux som går ind i cellen og flux som går ud af cellen og måler og finder ligevægt. |
|
|
Term
Hvorfor er transmembranpotentialet negativt indeni og positivt udenfor? |
|
Definition
- aktiviteten af Na + / K + -ATPase - K + -selektive ionkanaler - tæt på Nernst-distribution af kloridioner - negativt ladede proteiner inde i celler |
|
|
Term
Nævn en F-type pumpe og forklare kort hvor de fungere |
|
Definition
Det sidste protein i elektrontransportkæden er en F-type transport protein og denne udnytter proton gradienten til at danne ATP.
Ligesom en mølle: rotation fører til ATP - rotationen er koblet med transporten af H+ med sin koncentrationsgradient. Ved reaktionen sker der ingen rotation. Ved rotation sker der ingen reaktion.
Bonus; Danner ATP modsat V-type transport protein, som bruger ATP til at opnå en gradient --> bruger elektrontransporten til at danne ATP. |
|
|
Term
Beskriv ABC-super family pumpen og hvad kan et problem være med dem? |
|
Definition
ABC-familien består af transporten af lipofile substansers over membranen, så som fedstoffer og lipider.
Problemer med ABC transporter kan føre til ophobning af stoffer i cellerne.
Bonus; - Bakterielle ABC transportere kan opreguleres og føre til fjernelse af lægemidler = resistent.
- Mutationer i ABC transporter kan påvirke mange metaboliske processer (f.eks. galdedannelse, cholesterolefflux fra celler, fedtsyreimport i peroxisomer etc.). |
|
|
Term
Der findes tre generelle klasser af transportsystemer, uniport, symport og antiport. Kom med et eksempel på symport |
|
Definition
Lactose eller et sukkermolekyle kan ikke bare komme over membranen, så den har brug for en gradient til at komme over.
Transporten af laktose kobles til transporten af H+
Der sørges derudover for en H+ gradient udenfor cellen, så de kan tage laktose med ind i cellen. |
|
|
Term
|
Definition
bruger H + -gradienten til at eksportere hydrofobe molekyler Ligner lidt ABC transporter, men her er den ikke aktiv.
Bonus; Kolesteroltransport ud af lysosomer udføres også med RND-permease |
|
|
Term
Forklar Cotransport og kom med eksempler |
|
Definition
Koblet transport med et membranprotein.
Mennesker bruger gradienten af natriumioner og membranpotentialet genereret af natriumpumpen for at drive aktiv transport af næringsstoffer ind i cellen.
Symporter i tarmen transporterer Na+ sammen med glukose. |
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
Beskriv primær aktiv transport |
|
Definition
Almindelig transport, hvor noget transporteres imod sin koncentrations gradient ved forbrug af ATP. Her skal der ske ATP-hydrolyse. [image] |
|
|
Term
|
Definition
et stof som transportes en vej |
|
|
Term
|
Definition
to stoffer som tranportes i samme retning på samme tid |
|
|
Term
|
Definition
to stoffer som transportes i modsatretning |
|
|