Term
| Hoe werkt de transcriptie in eukaryoten? |
|
Definition
RNA polymerase gaat over het DNA. RNA wordt gevormd over de template strand (zodat de RNA een kopie is van de coding strand)
[image] |
|
|
Term
| Noem 2 verschillen tussen prokaryotic en eukaryotic mRNA |
|
Definition
Bij prokaryoten worden meerdere eiwitten gevormd uit 1 mRNA strand, heeft geen bescherming aan uiteinde.
bij eukaryoten wordt er maar 1 eiwit gevormd uit 1 mRNA, heeft 5'cap en poly A staart.[image] |
|
|
Term
| Hoe werkt de synthese van de 5'cap? |
|
Definition
- pppNpNp
- ppNpNp
- GpppNpNp
- add methyl to Gp
- add methyl to Gp
- Deze capping factors bevinden zich op de RNA polymerase
[image] |
|
|
Term
| Hoe kan een eukaryoot toch verschillende eiwitten maken uit 1 mRNA strand? |
|
Definition
| Door alternative splicing |
|
|
Term
| hoe wordt transcriptie getermineerd |
|
Definition
RNA polymerase cleaves to poly-A signals encoded in DNA. CPSF en CstF gaan van de RNA polymerase naar de RNA strand.
- Poly-A polymerase adds + poly-A binding protein.
[image] |
|
|
Term
| hoe tranpsorteert mRNA naar cytoplasma? |
|
Definition
| mRNA heeft een nuclear export receptor waardoor het mRNA uit de nucleus gaat. initiation factors for protein synthesis (elF4G, elF4E) binden aan het mRNA. translatie |
|
|
Term
| Hoe wordt een codon omgezet naar aminozuur? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| De laatste base van het codon bindt minder sterk waardoor eigenlijk de eerste 2 alleen bepalen welk aminozuur er aan moet. |
|
|
Term
| Hoe wordt het aminozuur aan tRNA gekoppeld? |
|
Definition
| Door aminoacyl-tRNA synthetase |
|
|
Term
| Hoe werkt de kwaliteitscontrole van de inbouw van een aminozuur? |
|
Definition
| Dit gebeurt door editing. Wanneer een incorrect aminozuur is ingebouwd past deze niet in de synthesis site waardoor het aminozuur naar de editing site wordt getransporteerd en hier wordt verwijderd. |
|
|
Term
| Hoe verloopt de ribosomale eiwitsynthese. (4 stappen) |
|
Definition
stap 1. Eiwitketen in de P-site en nieuw tRNA in de A site.
stap 2. eiwitketen bind aan A site.
stap 3. Ribosoom loopt codon verder
stap 4. eiwitketen weer in P-site
[image]
[image][image] |
|
|
Term
| Wat doen elongatiefactoren bij eiwitsynthese? |
|
Definition
| Als er een fout aminozuur in het ribosoom terecht komt wordt deze verwijderd. Hierdoor ontstaat er een lege ruimte in het ribosoom die wordt opgevuld door de elongationfactor om terminatie te voorkomen. |
|
|
Term
| hoe wordt translatie geïnitieerd? |
|
Definition
Small ribosomal subunit met initiator tRNA, elF2.
mRNA bind aan small subunit.
small subunit zoekt naar AUG codon.
zodra deze is gevonden bind het grote subunit en de initiation factors dissociate
[image]
[image] |
|
|
Term
| Hoe werkt antibiotica op bacteriën? |
|
Definition
|
|
Term
| Hoe wordt translatie getermineerd? |
|
Definition
codon UAG wordt bereikt. release factor bind in de A-site.
[image] |
|
|
Term
| Het mRNA is gesynthetiseerd en ondergaat splicing. Hoe verloopt de kwaliteitscontrole van mRNA voordat het de nucleus uitgaat? |
|
Definition
| Een mRNA heeft bestaan uit intronen en exonen. Bij goed mRNA zul je geen intronen meer vinden (te herkennen aan exon junctions). Abnormale mRNA bevat nog introns, zodra het de kern uitgaat wordt het gedegradeerd door Upf. Nonsene-mediated mRNA decay |
|
|
Term
| Nadat de eiwitten zijn gevormd moeten ze nog gevouwen worden. Welke eiwitten helpen hierbij? |
|
Definition
Chaperone eiwitten
HSP70 en HSP60
[image] |
|
|
Term
| Hoe werken HSP70 en HSP60 bij de eiwitvouwing? |
|
Definition
HSP70 bindt aan hydrofobe oppervlaktes en kan zo het vouwen begeleiding vanuit het ribosoom
HSP60 werkt pas als het eiwit al compleet verkeerd gevouwen is. Het gaat in een soort ton waar een deksel opgaat en hier wordt het eiwit correct gevouwen |
|
|
Term
| Als het eiwit het ribosoom verlaat kan het 3 manieren van vouwing ondergaan. welke 3 zijn dit? |
|
Definition
1. correctly folded without help
2. correctly folded with help
3. incompletely folded - digested |
|
|
Term
|
Definition
Target protein met polyubiquitin chain arrives and is destroyed in the active sites.
[image]
[image] |
|
|
Term
| Welk eiwit is verantwoordelijk voor eiwitdegradatie |
|
Definition
|
|
Term
| Hoe werkt het mechanisme van ubiquitinilering |
|
Definition
ubiquiting activating enzyme + ubiquitin -> binding to ubiquiting ligase -> ubiquiting ligase primed with ubiquitin.
Het eiwit heeft een degradation signal on target protein dat bind met het ubiquiting ligase.
[image]
[image] |
|
|
Term
| Op welke 3 manieren kan ubiquitin geactiveerd worden? |
|
Definition
- phosphorylation
- ligand binding
- allosteric transition - subunit addition |
|
|
Term
| Hoe werkt de regulering van de meta naar anaphase bij meiose? |
|
Definition
| inactive APC/c binds to Cdc20 -> active APC/C. Active APC/c degradates securin -> active separase [image] |
|
|
Term
| Hoe wordt het degradatiesignaal op een eiwit geactiveerd? |
|
Definition
- phosphorylation
- unmasking by protein dissociation
- creation of destabilizing N-terminus |
|
|
Term
| Ubiquitine modificaties hebben vele betekenissen. Noem er 3 |
|
Definition
- monoubiquitylatoin : histone regulation
- multiubiquitylatoin : endocytosis
- polyubiquitylation : degradation, DNA repair
[image] |
|
|
Term
| Noem een Prion ziekte en leg uit hoe deze ontstaat |
|
Definition
Creutzfel Jacob
- conformational change of protein
- forming heterodimer - homodimer - amyloid
[image] |
|
|
