Term
| Noem 4 basisbegrippen van DNA |
|
Definition
- opgebouwd uit nucleinezuren
- dubbelstrengs ontstaat door waterstofbruggen
- altijd 5' aan 3' koppeling
- biosynthese van 5' naar 3' richting |
|
|
Term
| Hoe is de organisatie van DNA in een eukaryotische cel. wat zijn de gevolgen |
|
Definition
in tegenstelling tot prokaryoten ligt het DNA bij eukaryoten in hoge mate geordend in de kern.
Gevolgen
- betere controle genexpressie
- activatie en deactivatie van complete chromatine-gedeeltes |
|
|
Term
| Waaruit bestaan chromosomen (3) |
|
Definition
- gepaarde chromosomen
- telomeer, centromeer
- origin of replication
- euchromatine
- heterochromatine |
|
|
Term
| Welk enzym knipt linker DNA |
|
Definition
|
|
Term
| Hoe wordt een nucleosome geassembleerd |
|
Definition
H3-H4 dimer vormt H3-H4 tetramer
H2A-H2B vormen dimer
DNA vouwt om de H3-H4 tetramer
two dimers bind to a H3-H4;H2A-H2B octamer[image] |
|
|
Term
| Welk enzym helpt bij de remodeling van een (nucleosome sliding) |
|
Definition
ATP-dependent chromatin remodeling complex
[image] |
|
|
Term
| Hoe werkt histon uitwisseling bij DNA remodeling? |
|
Definition
Het remodeling complex maakt DNA losser. 2 opties
1. exchange of H2A-H2B dimer by histone chaperone
2. Histone chaperone completely deletes histon - DNA lacking nucleosome - exchange of nucleosome core |
|
|
Term
| Wat is de functie van histone H1 |
|
Definition
| stabilizeren van linker DNA |
|
|
Term
| Hoe wordt de centromeerlocatie bepaald in een histon? |
|
Definition
| Door gemodif[image]iceerd histon H3 |
|
|
Term
| Hoe werkt de replication van histones? |
|
Definition
1. Normaal nucleosome: H3-H4 dimer blijft aan het DNA vast zitten. H2A-H2B bindt.
2. Centromere-specific nucleosomes: H4-CENP-AH3 blijft aan DNA vast zitten en H2A-H2B dimer bindt.
[image] |
|
|
Term
|
Definition
Wetenschap die zich bezighoudt met overerving van eigenschappen die niet ontstaan door veranderingen in nucleotide sequentie maar door:
- Gen-regulerende eiwitten
- Erfelijke modificaties van:
--Histon eiwitten en DNA |
|
|
Term
| Hoe werkt de regulatie van Gen-activiteit genetica VS Epigenetica? |
|
Definition
Genetic: gene is set off by DNA change and stays off Epigenetic: gene is set off by chromatin change and stays off in somatic cells BUT becomes active in germ cells
[image] |
|
|
Term
| Wat is het verschil tussen hetero en euchromatine? |
|
Definition
Euchromatine- DNA zit losser dus hier zitten de meest actieve genen
hetero: Ligt strak verpakt en is lastig uit te lezen |
|
|
Term
| Hoe werkt Lysine acetylering en methylering? |
|
Definition
Acetyl: Lysine + COCH3 (positief naar neutraal)
Methylering: H verandert in CH3 groep (blijft positief) |
|
|
Term
| Hoe werkt serine phosphorylatoin |
|
Definition
|
|
Term
| Hoe werkt het uitlezen van de histon code? |
|
Definition
| Door covalent modification (acetyl - methyl -phosphorylation) heeft de histone een 'mark' waar een scaffold protein aan kan binden. Dit scaffold attracts andere componenten. dit kan leiden tot activatie-deactivatie of een andere functie |
|
|
Term
| Histon H3 is verantwoordelijk voor de regulatory sequences. Deze kan modificaties ondergaan, Leg dit uit |
|
Definition
| Histon H3 kan modificaties ondergaan die leiden tot: H3 methylation = gene silencing H3 Methyl+acyl = gene expression H3 Phosphor+acyl = gene expression |
|
|
Term
| Hoe werkt de verspreiding van de chromatine modificatie? |
|
Definition
Werkt DMV kettingreactie
- gene regulatory protein binds
- 'writer' attaches
- code-reader protein attaches
- together form a reader-writer complex
- samen met ATP-dependent chromatine remodeling complex en ATP ontstaat er chromatin condensation[image] |
|
|
Term
| Hoe wordt chromatine condensatie geremd? |
|
Definition
| De spreading heterocromatin is stopped by a barrier protein[image] |
|
|
Term
| Hoe werkt de overerving van modified chromatine replicatie ? (epigenetice) |
|
Definition
| chromosome duplication new heterochromatin proteins added to modified histones [image] |
|
|
Term
| Hoe verandert de activiteit van een gen in de nucleus? |
|
Definition
| Door locatieverandering naar gene expressoin place[image] |
|
|
