Term
| Post transkriptional kontrol |
|
Definition
| Sker efter RNA polymerasen har bundet til hentes promoter og begynder RNA syntesen --> Er cruical for regulation af mange gener. |
|
|
Term
| Transkription attenuation |
|
Definition
| Gener fra expression inhibieres af termination af transskription |
|
|
Term
| Hvordan fjerner man attenuationen fra den nascente RNA kæde? |
|
Definition
| Når gen produktet skal bruges, så vil regulatoriske proteiner binde til nasvent RNA kæden og fjerne attentuationen, og derved vil transkrptionen fortsætte med RNA molekylet. |
|
|
Term
| RNA spiller en vigtig rolle i både ? |
|
Definition
| DNA og proteiner samt både lagerering af arveligt informationer og katalysering af kemiske reaktioner |
|
|
Term
|
Definition
| RNA former kontrol apparter. Riboswitched er små sekvenser af RNA som ændre deres konfirmation under binding af små molekyler f.eks. metabolitter. |
|
|
Term
| Riboswitches genkender flere små molekyler |
|
Definition
| Nej, genkender et specifiks molekyler og derved sker der konformation ændring som bruges til regulator gene expressionen. |
|
|
Term
| Hvor er Riboswitches lokaliseret? |
|
Definition
| Ofte nær 5' enden af mRNA og de folder mens mRNA bliver syntheliseret, blokeret eller tillader udviklingen af RNA polymerasen om så de regulatoriske små molekyler er bundet. |
|
|
Term
| Riboswitch reagere på mængden af guanin, sandt eller falsk? |
|
Definition
|
|
Term
| Lav mængde af guanin, hvad sker der så? |
|
Definition
Der vil opstå elongering af RNA polymerasen, som trenaskriptere purine biosynthesen genet --> Enzymer bruges til guanain synthesen og derved bliver expressed
(A)
[image] |
|
|
Term
| Høj mængde af guanun, hvad der sker så? |
|
Definition
Binder til riboswitch og der vil derfor opstå konfirmation ændring som tvinger RNA polymerasen til at terminaler transkriptionen.
[image] |
|
|
Term
|
Definition
| Forkorter transkript af mange eukaryote gener ved at fjerne introns sekvensen fra mRNA precursor. |
|
|
Term
|
Definition
| Nogle celler kan splejse RNA transkript på forskellige måder og derved lave forskellige polypeptid kæder fra samme gen |
|
|
Term
| Hvorfor sker der alternativ RNA splicing? |
|
Definition
| Sker grundet der er en intron sekvens som er utydelig |
|
|
Term
| RNA splicing kan bliver reguleret negativt eller positivt, forklar dem begge. |
|
Definition
Negativt: Regulatorisk molekyle som forhindre splicing maskinen fra af opnå afgang til et bestemt splejsning site på RNA
positivt: Regulatorisk molekyle som hjælper direkte splejsning maskinen til et overlooked splice site (Fig 7-58)
[image] |
|
|
Term
Forklar figuren: Regulation of the site of RNA cleavage and poly-A addition determines
whether an antibody molecule is secreted or remains membrane-bound
[image] |
|
Definition
A) Kun det stærke binding sites som kløves
B) stigning af CstF – Både stærk og svag binding sites kløves.
Fordi A har et stærkt bindingssite, så og der kun er CstF til stede, så vil den kune binde sig ved det stærke sted. Det gør at membran mRNA vil synthelisere B cellen med bundet antistoffer da der er lav CstF. Men når der er høj CstF så vil de både binde sig til weak og strong bindingssite og derfor vil membranen af C celler være aktive. |
|
|
Term
|
Definition
| Som ændre nucleotid sekvensen af RNA transkript når de bliver syntheliseret og derved ændring i kodet messsage som de bære |
|
|
Term
| Hvilke to typer mRNA editing findes der? |
|
Definition
1. Deamination af adenin til producere inosone (A til I editing)
2. Deamination: Cytosin til producere uracil (C til I editing) |
|
|
Term
| HVad sker der hvis editing finder sted i kodning regioner? |
|
Definition
| Den kan ændre aa sekvensen af protein eller producere en afkortet protein ved at danne stop codon. |
|
|
Term
| Hvad sker der hvis editing finder sted udenfor kodning regioner? |
|
Definition
| Kan påvirke forældre af pre mRNA splicing, af transporten af mRNA fra nukleus til cytosol. |
|
|
Term
| Enzymet ADAR (adenosine deaminases acting on RNA) har funktion? |
|
Definition
| Laver en bestemt form for editing, som genkender double strenget RNA struktur som formes via base parring mellem sitet som bliver edited hvor den komplementære sekvens er lokaliseret på samme RNA molekyle typisk i introns. (fig 7-60 |
|
|
Term
Hvad sker der her på billedet?
[image] |
|
Definition
| C til U editing bliver båret ud af forskellige set af enzymer . i nogle celler vil mRNA af apoliopoprotein B undergå C-U editing som danner stop codon, hvilket resultere i et forkortet proteiner. |
|
|
Term
| Hvad sker der med en nydannet mRNA molekyle og hvad møder det? |
|
Definition
| Den bliver passeret via nuclear pore ig når ind til cytosol hvor den som realt bliver mødt af ribosomet hvor den så bliver translateret til polypeptid kæde. |
|
|
Term
| Hvad sker der med de fri ribsomer i cytosolen? |
|
Definition
| Frie ribosomer i cytosolen synthelisere hele proteinet og signalet i polypeptid kæden diagere proteinet til dt andre site i cellen. |
|
|
Term
|
Definition
| Koder for proteiner som kløver flere mindre proteiner som former en viral capsid. |
|
|
Term
|
Definition
| Koder for et proteiner som kløver til producering af reverse transkriptase (Som transkrptere RNA til DNA) |
|
|
Term
|
Definition
| koder for envelope proteiner |
|
|
Term
|
Definition
Virusen koder for et protein kaldet Rev, som binder til specifik RNA sekvens som kaldes for RRE i viral intron.
Rev proteiner interagere med nuclear export receptor (CrRM1 receptoren.
[image] |
|
|
Term
| Hvor vil man forvente mRNA er lokaliseret i cytosolen? |
|
Definition
De kræver et specifik signal i mRNA den selv. Disse signaler er somrealt koncentreret i 3' utranlsateret region (UTR) som er dt region af RNA som forlanger fra stop codon som terminer protein syntesen til at starte poly A halen.
[image] |
|
|
Term
| mRNA lokalisationen involvere? |
|
Definition
| På cytoskeltal (MT) transporten |
|
|
Term
| Hvornår vil eukaryote celler øge deres protein syntese? |
|
Definition
| Sker under forskellige situationer f.eks. tab af vækst faktor eller næring, infektion af virus og pludselig øgning i temperatur. |
|
|
Term
| Hvad skyldes en forøgning af protein syntesen? |
|
Definition
| Sker grundet phosphorylering af translation initiation faktor eIF2 af specifikke protein kinaser som reagerer på ændring i kondition |
|
|
Term
| Forklar eIF2 og når den genkende AUG codon |
|
Definition
- Former kompleks med GTP og formidler binding af methionyl initiator tRNA til et småt ribosomal subunit som binder til 5' enden af mRNA og begynder scanningen langs mRNA
- Genkender AUG og derved vil eIF2 hydroliserer det bundet GTP til GDP --> Der sker en konformationsændring i proteinet og frigivet det fra det smalle ribosomal subunit. Large ribosomal subunt hæftes til det komplete ribosom og protein syntesen begynder. |
|
|
Term
|
Definition
|
|
Term
Regulation af protein synthesen af eIF initiation factor: Hvorfor skal eIF2B frigive GDP?
[image] |
|
Definition
| eIF2 binder stramt til GDP, og derved kræver det for eIF2B af frigive GDP så nye GTP molekyle kan binde og eIF2 kan genanvendt. |
|
|
Term
Hvad sker der med det genanvendte eIF2?
[image] |
|
Definition
| Bliver inhibiteret når den phosphoryleres. Det phosphorylerede eIF2 binder til eIF2B stramt, og derved bliver eIF2B inaktiveret. |
|
|
Term
Hvad er der mest af? eIF2 eller eIF2B in cells
[image] |
|
Definition
| Mere af eIF2 i cellen, da man bruger det til at sænke protein syntesen |
|
|
Term
| Hvad er det som scanner AUG på dwonstream af 5' enden af mRNA? Og hvad hvis der er for lidt genkendelses site? |
|
Definition
| Det small ribosomal subunit genkender AUG. Men når der er for lidt, så vil scanningen af ribosomal subunit til tider ignorer det først AUG codon i mRNA og derved tag det anden eller tredje AUG codon. |
|
|
Term
|
Definition
| Stategisk frekvens sokm bruges til at producere to eller flere tætte relateret proteiner, som er forskellige kun i N-terminalen fra det samme mRNA. |
|
|
Term
|
Definition
| Type kontrol fundet i eukaryote celler som bruger en eller flere open reading frames. KOrte aftræk af DNA som begynder med start codon ATG og har KUN det ene stop codon i enden. |
|
|
Term
| Upstream open reading frames (uORDFs) |
|
Definition
| aa sekvenser kodes af upstream uORFs som ikke er særlige vigtige. uORF på mRNA vil som realt forøge translationen af downstream genet ved at tilføje scanning ribosome initiation complex |
|
|
Term
| Internal ribosome entry site (IRES) |
|
Definition
| Bruges når cellen starter translationen ved positionen fra 5' ende af mRNA, som bruger specialiserede type af RNA sekvenser som kaldes for IRES. |
|
|
Term
| Ændring i mRNA stabilitet kan regulere gen expression? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| Et enzymes som nedbryder i 3' til 5' retning som årsag til ødelæggelse af mRNA. Fordi dens mRNA er både syntheliseret men også nedbrudt, så kan en bakterie hurtigt ændre sig i forhold til miljø |
|
|
Term
| Internal ribosome entry site (IRES) |
|
Definition
| Bruges når cellen starter translationen ved positionen fra 5' ende af mRNA, som bruger specialiserede type af RNA sekvenser som kaldes for IRES. |
|
|
Term
| Ændring i mRNA stabilitet kan regulere gen expression? |
|
Definition
|
|
Term
|
Definition
| Et enzymes som nedbryder i 3' til 5' retning som årsag til ødelæggelse af mRNA. Fordi dens mRNA er både syntheliseret men også nedbrudt, så kan en bakterie hurtigt ændre sig i forhold til miljø |
|
|
Term
| Der findes to makensimer for at ødelægge hver mRNA som lavet af cellen. Hvilke? |
|
Definition
Poly A halen og 5' Cap
Poly A virker som en timer, som tæller ned for hver mRNA: Når pony A halen er reduceret til længden 25 nukleotider, vil de sprede sig. 5' cap fjernes og det resterende mRNA bliver degraderet fra dens 5' ende.
[image] |
|
|
Term
| Competition between mRNA translation and decay |
|
Definition
|
|
Term
Hvad sker der i figur A og B?
[image] |
|
Definition
a) Under jern mangel,er der binding af acoitase til 5' UTR af ferritin mRNA som blokere translation starten. Den bilder til 3' UTR af tranferrin receptor mRNA blokere en endonuclease cleavage site og stabilisere derfor mRNA.
B) Når jerne koncentrationen øges i cytosomet, så vil cellen øge den synthese af ferritin for at skulle binde de ekstra jern og derved sænke dens synthese af transferrin receptor for at skulle importer mindre jern over plsmamembranen |
|
|
